يُركّب صندوق تمرير بين المناطق المصنفة وغير المصنفة. يمرّ المواد عبر هواء مُرشّح عموديًا بواسطة مرشح HEPA. بالإضافة إلى ضوء الأشعة فوق البنفسجية ونظام التعشيق، يُجهّز صندوق التمرير الديناميكي بمرشح HEPA شفط بحجم 0.3 ميكرون تقريبًا. كما يحتوي على مقياس ضغط تفاضلي يتراوح من 0 إلى 250 باسكال، ومروحة نفخ لإزالة جزيئات الغبار.